生物学

脊椎動物の視物質のゲノムに関する研究をしています。

AIエージェント（Claude Code）に、ヒトとゼブラフィッシュの視物質遺伝子の配列取得からアラインメント・スペクトル調節部位の比較までを任せてみた作業記録。手順・検証方法・つまずいた点をそのまま公開します。

2024〜2026年、基盤モデルとクラウド化でバイオインフォマティクスは激変した。ゲノム言語モデルの進化と、自宅サーバー運用経験から見えた「個人でも解析に触れられる時代」を解説する。

利根川博士が受賞されたのは「ノーベル生理学・医学賞」です（1987年受賞）。日本人として同賞を受賞した初めての人物であり、同一分野で複数人が共同受賞することが多いノーベル賞において、稀少な単独受賞を果たしたことでも知られています。

東京水産大学、海洋生産学、魚群行動学研究室の有元貴文教授におすすめ頂いた書です。

初版より長く愛され続ける教科書が待望のカラー化! 高校で生物を学んでいない方にとってわかりやすい解説と細部までこだわったイラストが満載

遺伝子診断の方法が紹介されています。

行動遺伝学入門: 動物とヒトの“こころ”の科学。ヒトを含む様々な生物の遺伝的情報があります。

現時点で生じた疑問をChatGPT5にぶつけてみました。色相を考えた時に波長間に黄色やオレンジがある赤と緑の区別がつきにくくなるのか、教えて下さい。赤緑の色覚異常（いわゆる色弱）は、ヒトの網膜にある錐体細胞の種類と感度のズレに由来します。

塩基配列データベースとして、DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データベースがあるが、私はヒトとゼブラフィッシュの視物質遺伝子について知りたい。

アクセッション番号とKEGGについて調べました。

用語解説です。

生物学辞典の紹介と活用法。生命科学を学ぶ際の基礎用語の確認や、専門分野の理解を深めるためのリファレンスとしておすすめの一冊です。

生化学辞典の紹介。タンパク質・酵素・代謝経路など生化学の専門用語を網羅した辞典で、生命科学の学習・研究に欠かせない参考書です。

魚類のDNA研究に関する解説。遺伝子配列の解析手法やデータベースの活用方法など、水産生物学・分子生物学の基礎知識をまとめています。

バイオインフォマティクス事典の紹介。ゲノム解析・配列比較・データベース活用など、生命情報科学の主要トピックを網羅した実用的な一冊です。

ゼブラフィッシュが実験動物として注目される理由を、特徴・利点・メダカとの違いから解説。研究を始める方におすすめの入門書「ゼブラフィッシュ実験ガイド」も紹介します。

理系総合のための生命科学, 第2版。東京大学発の新定番テキストが堂々の改訂です! 理・医・農・薬・歯学部など生物系を専門とするなら最低限知っておきたい各分野の基礎を網羅した，学生・研究者必携の1冊!

はじめてのバイオインフォマティクス。基礎の基礎から解説!この1冊で、分子生物学の基本からバイオインフォマティクスの全体像までが、初心者にもよくわかる!

バイオインフォマティクスのためのPerl入門 単行本 - 2002/11/15水島 洋 (著, 翻訳), 明石 浩史 (翻訳), ま たぬき (翻訳), 小林 慎治 (翻訳)10年前であればコンピュータと生物学分野ような学術領域が重なりあうことは、ほとんどなく、生物学分野の研究においてコンピュータが中心的な役割を担てはいなかった。生物学は顕微鏡などで観察することが中心であったのである。しかし、現在ではヒトゲノム解析などのようにコンピュータは生物学的問題の発見や解析の過程において必要不可欠なものになり、生物学とコンピューティングの最先端の領域は互いに収束しつつある。このことは、生物学、遺伝学、新薬発見、医学といった分野に大変革をもたらしている。本年1月に発行して、反響を呼んだ『実践バイオインフォマティクス』の続編にあたる本書は、バイオインフォマティクスの分野でデータ解析の定番ツールとして、実際の研究現場で多用されている、Perl言語によるプログラミングについての手引き書である。Perl言語の基礎をわかりやすく解説するだけでなく、実例として実際の生物学的データを活用した実践本位の内容となっ...

バイオインフォマティクス基礎講座: 一歩進んだ発想をみがくために 単行本 - 2003/9/1アーサー・M. レスク (著), Arthur M. Lesk (原名), 岡崎 康司 (翻訳), 小沢 元彦 (翻訳), 坊農 秀雅 (翻訳)あなたにバイオインフォマティクスの真髄を伝えたいD.W.Mount著の日本語版「バイオインフォマティクス」（MEDSI 2002年）を補完する位置付けにある、入門テキスト。蛋白質構造データベースの草分けA.M.Leskが著者であり「タンパク質の構造」については豊富な事例をあげて説明されている。独学でも確実に知識が身につくよう、各章末には、内容確認問題とウェブを使用した実践問題全193題を収載。基礎から学びたい学生の教科書としてだけでなく「バイオインフォマティクスは若手にまかせている」というベテラン研究者も必読の書。内容（「MARC」データベースより）バイオインフォマティクスの真髄を解説。独学派から教室の学生、基本だけは知っておきたいベテラン研究者にも最適。基礎の理解と飛躍のための演習問題全193題を収録。出版社：メディカルサイエンスインターナショナル ...

バイオインフォマティクス ゲノム配列から機能解析へ 第2版 大型本 - 2005/12/15マウント デービッド W. (著), 岡崎 康司 (著), 坊農 秀雅 (著)出版社：メディカル・サイエンス・インターナショナル (2005/12/15)発売日：2005/12/15言語：日本語大型本：672ページISBN-10：4895924262ISBN-13：978-4895924269

東京大学バイオインフォマティクス集中講義。専門知識は不要！どんな教育的背景をもった方でもわかるように工夫された講義科目と内容で，バイオインフォマティクスのはじめの一歩におすすめです．

実践バイオインフォマティクス。遺伝子解析やバイオ研究におけるコンピュータを使ったアプローチとして、ツールやデータベースの作り方、Unixファイルシステムや簡単なPerlプログラムの紹介、インターネット上のツールの活用法やそのデータの視覚化

ゲノムサイエンス、タンパク質科学の急速な進展に伴い、遺伝子、タンパク質の膨大なデータが蓄積されつつある。本書はこれらをどうやって使いこなすか、バイオサイエンス領域の一般のユーザーを対象としてやさしくわかりやすく解説する入門書である。

理化学研究所：新しいバイオインフォマティクス・ツール「ZENBU」を開発