学術

脊椎動物の視物質のゲノムに関する研究をしています。

現時点で生じた疑問をChatGPT5にぶつけてみました。色相を考えた時に波長間に黄色やオレンジがある赤と緑の区別がつきにくくなるのか、教えて下さい。赤緑の色覚異常（いわゆる色弱）は、ヒトの網膜にある錐体細胞の種類と感度のズレに由来します。

塩基配列データベースとして、DDBJ/EMBL/GenBank国際塩基配列データベースがあるが、私はヒトとゼブラフィッシュの視物質遺伝子について知りたい。

アクセッション番号とKEGGについて調べました。

用語解説です。

何よりも先に購入しておく本でした。岩波書店 生物学辞典 第5版 単行本　2013/2/27巌佐 庸 (編集), 倉谷 滋 (編集), 斎藤 成也 (編集), 塚谷 裕一 (編集)単行本 : 2192ページISBN-10 : 400080314XISBN-13 : 978-4000803144寸法 : 17 x 5.9 x 23.1 cm1996年の第4版刊行以降の、ヒトゲノム解読をはじめとする生物学の大変革を反映。新たな編者陣のもと、400名を超える専門家が、全項目を校閲し、1000を超える新項目を追加。生物学とその周辺分野を網羅した総合生物学辞典は、初学者から研究者まで、信頼のおける情報源として、インターネット時代にも必携の一冊。【第5版の特色】○1万を超えるすべての項目を校閲・改訂 ○さらに和文索引に膨大な用語を収録 ○1000を超える新項目を採用 ○関連項目を統合して体系的に解説 ○定評ある生物分類表も全面改訂【参考となるカスタマーレビュー(Amazon)】○分類体系が旧式この第5版が出た後に分類体系が変更されたので本書は残念ながら旧式の分類体系に基づいた内容となっている。○生物...

生化学辞典 第4版 単行本 - 2007/12/10大島 泰郎 (著)以下、Amazon レビューより引用生化学だけにとらわれず周辺領域も充実した。驚異的な速さで進歩・発展・専門分化している生命科学・医学の世界で生きて行くためには、研究者でも生化学・医学辞書は必要です。この『生化学辞典』は世界の生命科学・医学の中でいかに日本の生化学と関連分野の活力そして実績が優れているかを如実に示している辞書です。よい教科書とよい辞書を出版できるのは実力です。さらには学生の自主学習が推奨されている今こそ、信頼できる教科書、そしてそれを補い他分野と関連づけてくれる辞書が必須となっています。基礎医学の重要性を臨床医学に進んでからも確認できる、極めて優れものです。英語の専門用語 technical termが重要性を増す一方ですが、巻末索引により、英和機能も充実しています。生物学分野の人々には非常にポピュラーな岩波の生物学辞典とこの生化学辞典は何かとページをめくる機会の多い書籍です。本の帯タイトルの通り、生化学といっても非常に生物学に関連の深い内容の記載が多く、岩波の生物学辞典が少し古いことから、両者の組み...

魚類のDNA: 分子遺伝学的アプロ-チ 単行本 - 1997/6/10青木 宙 (編集)「MARC」データベースより現在までに行われてきた魚類の分子遺伝学的手法を用いた研究を網羅。最近開発された新しい遺伝子操作法や染色体操作、魚類の分類、系群、多様性や系統進化論、クローン研究やガン関連遺伝子など、さまざまな研究内容を解説。

バイオインフォマティクス事典 単行本 - 2006/7/1日本バイオインフォマティクス学会 (編集)Amazonより現在,大量に蓄積された医学・生物学情報から,新たな知識発見をもたらすためのツールとしてバイオインフォマティクスへの期待が各方面で高まっています。理学,工学のみならず医学・薬学・農学などからも,多くの学生・研究者・技術者がこの学問領域に参加してきています。バイオインフォマティクスの対象とする領域は固定的ではなく,ますます多様化し拡大していく傾向にありますし,単なるツール提供の役割にとどまらず,21世紀の生命科学の理論的根幹をなすものとしての成長も期待されています。今後さらに期待されるバイオインフォマティクスの広がりと深まりには,いっそうの多彩な背景をもつ人材の参入が必要です。本事典はこうした状況の中でバイオインフォマティクスの知的基盤を整備するため,バイオインフォマティクス学会の学会事業として総力を挙げて編纂したものです。

ゼブラフィッシュ実験ガイド 単行本（ソフトカバー） - 2020/11/1平田 普三 (著, 編集)Amazonよりゼブラフィッシュを使った実験を始める際に知っておきたい事柄を余さず伝授。ラボでの研究に必要なひととおりの知識が得られる一冊!【目次】1章 実験動物としてのゼブラフィッシュモデル動物としてのゼブラフィッシュの登場/ゼブラフィッシュの特徴と利点/ゼブラフィッシュの弱点/ゼブラフィッシュ vs メダカ/ゼブラフィッシュの学会・研究会2章 系統野生型系統/近交系/研究室における系統維持/他3章 飼育飼育システムの選択/飼育システムの立ち上げ/水質管理/餌/病気対処/他4章 交配と採卵オスとメスの見分け方/交配の方法/胚の飼育と状態チェック/他5章 発生生活環と寿命/発生/成魚の寿命と老化/成魚の解剖6章 仔魚の運動自発的コイリング/触刺激応答/マウスナー細胞によるC-bend/泳動/仔魚の運動のレパートリー/他7章 仔魚の行動視覚に依存する行動/仔魚の行動を測定する装置とソフトウェア/他8章 成魚の行動視覚行動/嗅覚行動/味覚行動/性行動/社会的順位と闘争行動/連合学習/他9章 ...

理系総合のための生命科学 第2版: 分子・細胞・個体から知る“生命”のしくみ 単行本 - 2010/2/1東京大学生命科学教科書編集委員会 (編集)東京大学発の新定番テキストが堂々の改訂です! 理・医・農・薬・歯学部など生物系を専門とするなら最低限知っておきたい各分野の基礎を網羅した，学生・研究者必携の1冊!出版社：羊土社 (2010/2/1)発売日：2010/2/1言語：日本語単行本：342ページISBN-10：4758120102ISBN-13：978-4758120104

はじめてのバイオインフォマティクス (KS生命科学専門書) 大型本 - 2006/12/18藤 博幸 (編集)基礎の基礎からていねいに解説!初心者にもよくわかる入門書バイオインフォマティクスを基礎の基礎から解説!この1冊で、分子生物学の基本からバイオインフォマティクスの全体像までが、初心者にもよくわかる!出版社：講談社 (2006/12/18)発売日：2006/12/18言語：日本語大型本：158ページISBN-10：4061538624ISBN-13：978-4061538627

バイオインフォマティクスのためのPerl入門 単行本 - 2002/11/15水島 洋 (著, 翻訳), 明石 浩史 (翻訳), ま たぬき (翻訳), 小林 慎治 (翻訳)10年前であればコンピュータと生物学分野ような学術領域が重なりあうことは、ほとんどなく、生物学分野の研究においてコンピュータが中心的な役割を担てはいなかった。生物学は顕微鏡などで観察することが中心であったのである。しかし、現在ではヒトゲノム解析などのようにコンピュータは生物学的問題の発見や解析の過程において必要不可欠なものになり、生物学とコンピューティングの最先端の領域は互いに収束しつつある。このことは、生物学、遺伝学、新薬発見、医学といった分野に大変革をもたらしている。本年1月に発行して、反響を呼んだ『実践バイオインフォマティクス』の続編にあたる本書は、バイオインフォマティクスの分野でデータ解析の定番ツールとして、実際の研究現場で多用されている、Perl言語によるプログラミングについての手引き書である。Perl言語の基礎をわかりやすく解説するだけでなく、実例として実際の生物学的データを活用した実践本位の内容となっ...

バイオインフォマティクス基礎講座: 一歩進んだ発想をみがくために 単行本 - 2003/9/1アーサー・M. レスク (著), Arthur M. Lesk (原名), 岡崎 康司 (翻訳), 小沢 元彦 (翻訳), 坊農 秀雅 (翻訳)あなたにバイオインフォマティクスの真髄を伝えたいD.W.Mount著の日本語版「バイオインフォマティクス」（MEDSI 2002年）を補完する位置付けにある、入門テキスト。蛋白質構造データベースの草分けA.M.Leskが著者であり「タンパク質の構造」については豊富な事例をあげて説明されている。独学でも確実に知識が身につくよう、各章末には、内容確認問題とウェブを使用した実践問題全193題を収載。基礎から学びたい学生の教科書としてだけでなく「バイオインフォマティクスは若手にまかせている」というベテラン研究者も必読の書。内容（「MARC」データベースより）バイオインフォマティクスの真髄を解説。独学派から教室の学生、基本だけは知っておきたいベテラン研究者にも最適。基礎の理解と飛躍のための演習問題全193題を収録。出版社：メディカルサイエンスインターナショナル ...

バイオインフォマティクス ゲノム配列から機能解析へ 第2版 大型本 - 2005/12/15マウント デービッド W. (著), 岡崎 康司 (著), 坊農 秀雅 (著)出版社：メディカル・サイエンス・インターナショナル (2005/12/15)発売日：2005/12/15言語：日本語大型本：672ページISBN-10：4895924262ISBN-13：978-4895924269

東京大学バイオインフォマティクス集中講義 単行本 - 2004/6/1東京大学理学部生物情報科学学部教育特別プ (編集)東京大学バイオインフォマティクス集中講義　東京大学理学部の学部学生向け生物情報科学特別教育プログラムの授業の1つである「生物情報科学概論」の講義ノートを基に書き下ろされた、バイオインフォマティクスの入門書。1章1講義として全13講義を掲載しており、必要な部分を選択して学べる。4章までの基礎編では情報科学と分子生物学の知識を解説し、残りの応用編で、遺伝子やたんぱく質、プロテオーム解析などバイオインフォマティクスの実際を記述する。巻末には、情報科学の教科書と、バイオ分野が専攻ではない人に向けた教科書の紹介を掲載している。　本書でカバーされている分野は幅広い。DNA2重らせんの物理化学的性質の解説から、たんぱく質の構造計算の基礎知識や、遺伝子の配列解析、機能解析など実際に利用されている技術を網羅的に解説している。また、最近になって注目されるようになった知識発見技術にも1章を割いている。さらに、ライフサイエンス研究のインフラであるデータベースの解説では、主要なデータベースの紹...

実践 バイオインフォマティクス -ゲノム研究のためのコンピュータスキル- 単行本 – 2002/1/28Cynthia Gibas (著), Per Jambeck (著), 水島 洋 (翻訳), 明石 浩史 (翻訳), ま たぬき (翻訳)ヒトゲノム解析プロジェクトやバイオテクノロジーにおいてコンピュータの利用は不可欠になっている。本書は、生物学者や生物学を学ぶ学生、企業の研究者に、遺伝子解析やバイオ研究におけるコンピュータを使ったアプローチとして、ツールやデータベースの作り方、Unixファイルシステムや簡単なPerlプログラムの紹介、そしてインターネット上のツールの活用法やそのデータの視覚化といった広範囲の内容を解説する。●生物学データ解析システムを構築するための唯一の実践確実なガイドブック！●大学、企業などの、学生から熟練の専門家に至る生化学の分野で広く読者へアピール！●もっともホットなトピックとして、日本の専門雑誌が特集や連載記事を掲載！ポストゲノムシークエンス時代の研究者に必須のスキルを実践的なアプローチで解説。本書で取り上げた主なシステムやソフトウェアツール、ウェブ情報●デ...

あなたにも役立つバイオインフォマティクス単行本 - 2002/10/15 菅原 秀明 (編集)ゲノムサイエンス、タンパク質科学の急速な進展に伴い、遺伝子、タンパク質の膨大なデータが蓄積されつつある。本書はこれらをどうやって使いこなすか、バイオサイエンス領域の一般のユーザーを対象としてやさしくわかりやすく解説する入門書である。インターネットに接続されたパソコンとブラウザさえあれば使えるデータベースと解析ツールについて、その利用方法と注意点を具体的に紹介するもので、実践的な解説をするために、検索や解析結果の実例画面を多数盛り込んでいる。データベースを使って必要なデータを集めるところから始めて、決定した配列からさまざまな“生物学的意味”を引き出し、最終的には公共データベースに登録するところまでを導く。出版社：共立出版 (2002/10/15)発売日：2002/10/15言語：日本語単行本：126ページISBN-10：4320055942ISBN-13：978-4320055940

理化学研究所：新しいバイオインフォマティクス・ツール「ZENBU」を開発