私は自作PCを使っていて、一度Linuxをインストールした内蔵型HDDにGRUBが存在して、Windowsをカスタムインストールできないという現象に悩まされていました。以下の方法で、Linuxのパーティションを完全に削除できることがわかりました。
これは私が強引にやった方法ですので、マネる方は自己責任でお願いします。
01.正常に動作しているWindowsPC（Windows11Pro）の電源が切れた状態で普通にあいているSATAに正常な内蔵型HDDを増設します。
02.Windowsを起動し、「スタート」メニューを右クリックし、「ディスクの管理」を選びます。
03.電源を切ることなく、増設したHDDをSATAケーブル・電源の順に取り外し、Linuxがインストールされた内蔵型HDDを接続します。
（電源を切って、Linuxがインストールされた内蔵型HDDを接続して起動すると、Windowsではなく、Linuxが起動してしまうでしょう。この辺が強引です。）
04.「ディスクの管理」画面でLinuxがインストールされた内蔵型HDDが認識されますが、「ディスクの管理」では削除しようとしても削除しきれないパーティションがあると思います。
05.Windowsの「スタート」メニューを右クリックし、「Windows PowerShell（管理者）」または「コマンドプロンプト（管理者）」を選択します。以下のコマンドを入れます。
（下記のXとYは「ディスクの管理」と照らし合わせながら慎重に選ぶ必要があります。絶対に間違えないで下さい。）
>diskpart
>list disk
>select disk X # Xはシステムディスクの番号
>list partition
>select partition Y # Yはシステムパーティションの番号
>delete partition override
>exit
06.再び「ディスクの管理」で、該当するパーティションを右クリックすると、ボリュームの削除やフォーマットができるようになっていると思います。これらを使うことで、Windowsが使える、まっさらな内蔵型HDDが出来上がります。
